Fiat maakte van veiligheid een absolute prioriteit bij de introductie van de Stilo, met een uitrusting die zelfs een klasse hoger geen evidentie is. Het model is uitgerust met driepuntsgordels en hoofdsteunen op alle plaatsen (ook achteraan), allen voorzien van spanners en spankrachtbegrenzers. Standaard monteert de constructeur 8 airbags. De twee frontale exemplaren voor bestuurder en passagier zijn daarbij van het multistage-type. De ontplooiing errvan is afhankelijk van de aard en de kracht van de impact, het gewicht van de passagier (bij de passagiersairbag) en het al dan niet dragen van de gordel. Bij een zijdelingse aanrijding wordt de schok gebroken door zijdelingse airbags, zowel voor- als achteraan terwijl gordijnairbags verhinderen dat een inzittende onzacht met zijkant van de dakhemel of de zijruiten in aanraking komt. De veiligheidssystemen worden gestuurd door een centrale regeleenheid in de middenconsole. Die zit daar optimaal beschermd en werkt ook nog als de stroom uitgeschakeld is.

Tot de actieve veiligheidssystemen behoren een ABS-systeem met remkrachtverdeler en noodremhulp. Zelfs een antispinsysteem, niet zo nuttig op de versies met beperkt vermogen, is standaard. ESP is niet verkrijgbaar op de instapversies, is een optie op de 1.6 en 1.9JTD van 115pk en wordt standaard gemonteerd op de versies met 1.8 of 2.4 benzinemotor.