Een stijve koets is de basis voor een hoge veiligheidsgraad, weten ze bij Seat. Voor de constructie van de Altea wordt dan ook voor 72% gebruik gemaakt van staal met een hoge weerstand en voor 2% zelfs van staal met een ultrahoge weerstand. Daardoor haalt de koets een structurele stevigheid van 20.000Nm per graad. Naast horizontale én diagonale verstevigingsbalken in de deuren zijn er drie verstevigingsringen ter hoogte van de stijlen. Ook is de Altea de eerste Seat die standaard op alle versies wordt uitgerust met zes airbags. Er zijn uiteraard driepuntsgordels op alle zitplaatsen, allen voorzien van pyrotechnische spanners. Nieuw is de actieve voetsteun die niet meer kantelt bij een impact en zo voetletsel helpt beperken. Tot de actieve systemen horen een geavanceerd ABS-systeem met remkrachtverdeler en tractiecontrole. ESP is steeds een optie van € 455.