Peugeot is niet krenterig geweest als het op veiligheidsuitrusting aankwam. Elke 1007 is immers voorzien van ABS met remkrachtverdeler en noodremhulp en stabiliteitscontrole. Het airbagpakket omvat steeds zeven plofkussens; twee frontale exemplaren, twee zijdelingse die in de rugleuning van de voorste zetels zijn ingewerkt en twee gordijnairbags. Een nieuwigheid in het segment is de knieairbag die onderaan de stuurkolom is gepositioneerd. Alle vier de gordels zijn vanzelfsprekend van het driepuntstype, en vooraan voorzien van een voorspanner met spankrachtbegrenzer van het pyrotechnische type. De zitplaatsen achteraan zijn voorzien van driepunts Isofix bevestigingspunten. De structuur van de 1007 is opgemerkt stijf. Een noodzaak om de werking van de deuren na een impact te vrijwaren. De veiligheid van het model werd door de EuroNCAP beloont met een score van 5 sterren.