Het veiligheidsarsenaal van de Peugeot 5008 omvat standaard ESP en ASR. De frontale airbags worden aangevuld met laterale airbags vooraan en gordijnairbags voor- en achteraan. De versies met zeven plaatsen zijn optioneel verkrijgbaar met een hoofd-/gordijnairbag die de inzittenden op de drie rij beschermt. Hij werkt met één generator en wordt gelijktijdig met de zijdelingse airbags opgeblazen om de veiligheid van de inzittenden te optimaliseren. Andere veiligheidsvoorzieningen zijn verklikkerlampjes voor het niet vastklikken van de gordel op alle plaatsen, de automatische elektrische parkeerrem met 'wegrijhulp op hellingen' en cruise control met snelheidsbegrenzer.

Het optionele parkeerplaatsmeetsysteem berust op het gebruik van twee sensoren aan de zijkanten van de voorbumper, die op het multifunctionele scherm van het instrumentenpaneel aangeven of een vrije parkeerplaats groot genoeg is en vervolgens de bestuurder begeleiden bij het manoeuvre. Verder is er 'Snow Motion' als optie, een intelligente stabiliteitscontrole die de bestuurder toelaat doeltreffend weg te rijden en te accelereren op ijzel of sneeuw, als is de aanvullende hulp van sneeuwbanden zeker aanbevolen. Eveneens optioneel en vernieuwend in deze autoklasse is het 'Head-up'-display, dat alle essentiële informatie voor het rijden projecteert tegen de voorruit, precies in het gezichtsveld van de bestuurder. Tenslotte is er ook nog de optie 'Distance Alert' die gebruik maakt van radartechnologie om de bestuurder te helpen bij het bewaren van de juiste veiligheidsafstanden tot de voorligger. Dit waarschuwingssysteem, laat zich op een waarde tussen 0,9 sec. en 2,5 seconden regelen met tuimelschakelaars op het dashboard.