De veiligheidsuitrusting van de Cube omvat standaard ABS en ESP. Verder zijn er zes airbags, waaronder in de voorzetels gemonteerde zijdelingse airbags en een over de ganse lengte lopende hoofdairbag. Op alle vijf zitplaatsen zijn driepuntsveiligheidsgordels gemonteerd. Voorin hebben ze bovendien een gordelspanner en spankrachtbegrenzer. Nissan kiest bij de Cube voor lichtere veiligheidsgordels met minder wrijving in vergelijking tot de gebruikelijke exemplaren, om het dragen comfortabeler te maken en zo de Cube-gebruikers aan te sporen om altijd - zoals overigens verplicht - de gordels te dragen. Eveneens standaard en veiligheidsverhogend, is de van op het stuurwiel instelbare cruise control met geïntegreerde snelheidsbegrenzer. Elke Cube beschikt standaard over een radio in dubbel DIN-formaat met Bluetooth®-koppeling voor het wettelijk en veilig handenvrij telefoneren in de auto. Andere items die bijdragen tot de veiligheid zijn de mistlichten en bij het hoogste uitrustingsniveau - Zen - de automatisch aangestuurde koplampen en ruitenwissers.